Les décisions de la Commission s’appuient sur les avis scientifiques émis par le Comité scientifique et ses groupes de travail. Les Membres mènent des recherches, souvent dans le cadre de collaborations, sur de nombreux sujets, tels que l’écosystème et l’environnement physique de l’Antarctique, l’écologie d’organismes clés, ainsi que l’impact des pêcheries sur les espèces visées et l’écosystème. La CCAMLR définit également les données que doivent fournir les navires de pêche et les observateurs scientifiques à bord de ces navires. Une grande partie de la zone couverte par la Convention CAMLR se trouve en haute mer. Par conséquent, les données sont regroupées à partir des contributions de plusieurs Membres en vue de leur analyse et les résultats sont examinés lors des réunions des groupes de travail et du Comité scientifique.   

La Commission a divisé la zone de la Convention en plusieurs zones plus petites, chacune étant soumise à des exigences de gestion spécifiques. Certaines zones sont fermées à certains types d'activités de pêche. D'autres sont ouvertes à la pêche, mais sont soumises aux exigences des mesures de conservation.

Les mesures de conservation de la CCAMLR comprennent des systèmes et des outils de suivi et de contrôle de la conformité qui garantissent une pratique de la pêche dans la zone de la Convention conforme aux principes de conservation de la Convention.